NRAO Home > CASA > CASA Task Reference Manual

0.1.48 importevla

Requires:

Synopsis
Convert an Science Data Model observation into a CASA Measurement Set

Arguments





Inputs

asdm

Name of input asdm directory (on disk)

allowed:

string

Default:

vis

Root name of the ms to be created. Note the .ms is NOT added

allowed:

string

Default:

ocorr_mode

Fill correlation mode AUTO_ONLY (ao), CROSS_ONLY (co) or CROSS_AND_AUTO (ca)

allowed:

string

Default:

co

compression

Flag for turning on data compression

allowed:

bool

Default:

False

asis

Create verbatim copies of these SDM tables in the MS.

allowed:

string

Default:

scans

List of scans to fill (default is all scans).

allowed:

string

Default:

verbose

Output lots of information while the filler is working

allowed:

bool

Default:

False

overwrite

Over write an existing MS

allowed:

bool

Default:

False

online

Create online flags

allowed:

bool

Default:

True

tbuff

Time padding buffer (in seconds)

allowed:

double

Default:

0.0

flagzero

Create flag commands for zero points

allowed:

bool

Default:

True

flagpol

Create flag commands for cross-hand correlations

allowed:

bool

Default:

True

shadow

Create flag commands for shadowed data

allowed:

bool

Default:

True

tolerance

Amount of shadow allowed (in meters)

allowed:

double

Default:

0.0

addantenna

File name or dictionary with additional antenna names, positions and diameters

allowed:

any

Default:

variant

applyflags

Apply flag commands to MS

allowed:

bool

Default:

False

savecmds

Save flag commands to an ASCII file

allowed:

bool

Default:

False

outfile

Name of ASCII file to save flag commands

allowed:

string

Default:

flagbackup

Back up flag column before applying flags

allowed:

bool

Default:

True

polyephem_tabtimestep

Timestep (days) for the tabulation of polynomial ephemerides. A value <= 0 disables tabulation.

allowed:

double

Default:

0.001

Returns
void

Example

 
Convert a Science Data Model (SDM) dataset into a CASA Measurement Set (MS).  
Will place online flags and specified clip/shadow flags into FLAG_CMD table  
and optionally apply to MS.  
 
Warning: This version is under development and is geared to handling EVLA  
specific flag and system files, and is otherwise identical to importasdm.  
 
        HISTORY: Task created v1.0 S.T. Myers 2010-03-11 (3.0.1)  
                 Last updated v9.0 S.M. Castro 2012-03-13 (3.4) code+doc  
 
Keyword arguments:  
asdm         -- Name of input SDM file (directory)  
                default: none;  
                    Example: asdm=’ExecBlock3’  
 
vis          -- Root ms or scantable name, note a .ms is NOT appended to name  
                default: none  
 
ocorr_mode   -- output data for correlation mode AUTO_ONLY  
                (ao) or CROSS_ONLY (co) or CROSS_AND_AUTO (ca)  
default: co (for EVLA)  
 
compression  -- produces comrpressed columns in the resulting measurement set.  
                default: False  
 
asis         -- creates verbatim copies of the ASDM tables in  
                the output measurement set. The value given to  
this option must be a list of table names separated  
by space characters; the wildcard character ’*’ is  
                allowed in table names.  
 
scans        -- processes the scans requested in this parameter (default is  
                all scans).  For simplest use provide a comma-separated list of  
scan ranges, e.g. scans=’1~3,5,10~20’.  
                default: ’’ = all scans  
 
                NOTE: A scan specification tecnically consists of an ExecBlock  
                index followed by the character ’:’ followed by a comma  
                separated list of scan indexes or scan index ranges. The EVLA  
                does not currently include more than one ExecBlock in a SDM  
                so this specification prefix is not needed.  
 
                By default all the scans are considered.  
 
overwrite    -- Over write an existing MS  
 
verbose      -- produce log output as asdm2MS is being run  
 
polyephem_tabtimestep -- Timestep (days) for the tabulation of polynomial ephemerides.  
               A value <= 0 disables tabulation.  
 
EVLA-specific parameters:  
-------------------------  
 
online       -- create flagging commands for online flags. The commands will be saved to the FLAG_CMD  
                sub-table of the MS. Optionally, it can also be saved to an ASCII file when savecmds is set  
                to True.  
                default: True  
 
            >>> online expandable parameters  
                 tbuff -- (float) time padding buffer (in seconds)  
                 default: 0.0  
 
                 NOTE: this time is in seconds. You should currently  
                 set the value of tbuff to be 1.5x the correlator  
                 integration time if greater than 1 second.  For  
                 example, if the SDM has integrations of 3 seconds,  
                 set tbuff=4.5.  Likewise, set tbuff=15.0 for 10-sec  
                 integrations.  
 
 
flagzero     -- create flags to clip out visibilities with zero values. The command will be saved to the FLAG_CMD  
                sub-table of the MS. Optionally, it can also be saved to an ASCII file when savecmds is set  
                to True.  
                default: True  
 
            >>> flagzero expandable parameter(s)  
                 flagpol -- (boolean) also zero-clip on cross-hands (default=False)  
 
shadow       -- create flags for antennas that are shadowed. The command will be saved to the FLAG_CMD  
                sub-table of the MS. Optionally, it can also be saved to an ASCII file when savecmds is set  
                to True.  
                default: True  
 
            >>> shadow expandable parameter  
                 tolerance -- Amount of shadowing allowed in meters.  
                   default: 0.0  
 
                 addantenna -- It can be either a file name with additional antenna names, positions  
                               and diameters, or a Python dictionary with the same information.  
                               You can use the flaghelper functions to create the dictionary from a file.  
                   default: ’’  
 
                   To create a dictionary inside casapy.  
                   > import flaghelper as fh  
                   > antdic = fh.readAntennaList(antfile)  
 
                   Where antfile is a text file in disk that contains information such as:  
                    name=VLA01  
                    diameter=25.0  
                    position=[-1601144.96146691, -5041998.01971858, 3554864.76811967]  
                    name=VLA02  
                    diameter=25.0  
                    position=[-1601105.7664601889, -5042022.3917835914, 3554847.245159178]  
 
 
applyflags   -- apply the online and specified flags to the MS  
                default: False  
 
 
savecmds   -- Save the flag commands to an ASCII file given by the parameter outfile. It will save the  
              flag commands from online, flagzero and/or shadow if they are set to True.  
                default: False  
 
            >>> savecmds expandable parameter  
                outfile      -- Filename where to save the flag commands.  
                default: ’ ’ --> by default it will save on a filename composed from the MS name.  
                    Example: vis=’evla.ms’, the outfile will be ’evla_cmd.txt’.  
 
                    NOTE: The file is open to save in append mode.  
 
 
flagbackup   -- Backup original flags in >ms<.flagversions  
                default: True  
 
       Examples:  
 
 
        1)  Produces MS CLowTest_000.ms with autocorrelations.  
            You will find the online, zero, and shadow flags in the FLAG_CMD table  
            for later application.  Does not apply any flags.  
 
             importevla(asdm=’CLowTest_000’,ocorr_mode=’ca’)  
 
 
        2)  Produces MS CLowTest_000.ms without autocorrelations.  
 
             importevla(asdm=’CLowTest_000’)  
 
 
        3)  Will apply online flags and uses a more conservative 2sec buffer  
                before the start and after the end timeranges.  
 
             importevla(asdm=’CLowTest_000’,online=True,tbuff=2.0,applyflags=True)  
 
 
        4)  This will create the FLAG_CMD sub-table using online flags only,  
            but will not apply them to the MS.  
 
            importevla(asdm=’CLowTest_000’,online=True,flagzero=False,shadow=False)  
 
 
        5)  This will write the online flags to the FLAG_CMD table. It will also save commands  
            to clip zeros and to flag shadowed antennas to the table. The commands will be further  
            applied to the data and the APPLIED column of the FLAG_CMD will be updated to True.  
 
            importevla(asdm=’CLowTest_000’,online=True,flagzero=True,shadow=True,applyflags=True)  
 
 
        6)  Import only scans 1, 2, 3, 5, 7, 9, save the online, shadow and clip commands to an ASCII file and  
            do not apply the flags. The commands will be saved to CLowTest_000_cmd.txt.  
 
            importevla(asdm=’CLowTest_000’,scans=’1~3,5,7,9’,online=True,flagzero=True,shadow=True,  
                                applyflags=False, savecmds=True)  
 
                You can use either flagdata or flagcmd to apply the flags later with the following commands:  
 
                Apply all the flags in the file using flagdata  
                flagdata(’CLowTest_000.ms’, mode=’list’, inpfile=’CLowTest_000_cmd.txt’)  
 
                Select by reason on the file  
                flagdata(’CLowTest_000.ms’,mode=’list’, inpfile=’CLowTest_000_cmd.txt’,  
                           reason=[’ANTENNA_NOT_POINTING’,’CORRELATOR_DATA_INVALID’])  
 
                Apply all the flags in the file using flagcmd  
                flagcmd(’CLowTest_000.ms’,inpmode=’list’,inpfile=’CLTest_000_cmd.txt’,action=’apply’)  
 
 
HISTORY: Task last updated v9.0 S.M. Castro 2012-03-8 (3.4.0)  
         Docs last updated v9.0 S.M. Castro 2012-03-13 (3.4.0)  
 


More information about CASA may be found at the CASA web page

Copyright © 2016 Associated Universities Inc., Washington, D.C.

This code is available under the terms of the GNU General Public Lincense


Home | Contact Us | Directories | Site Map | Help | Privacy Policy | Search